Using $session.MoveFile

$fileInfos = $session.EnumerateRemoteFiles($InputDir, $FilePattern, [WinSCP.EnumerationOptions]::MatchDirectories)
 
if ($fileInfos.Count -gt 0)
{           
   foreach ($fileInfo in $fileInfos)
   {
       Write-host("`r------ Action  --------------------`r")         
 
       # Download files           
       $transferResult = $session.GetFiles($fileInfo.FullName, "$OutputDir\", $False, $transferOptions)                   
 
       # Test file not Found
       if ($($transferResult.Transfers.count) -ne 0)
       { 
           #"[$todaylog] - [Action] $Action Transfer $filesCount files on $($transferResult.Transfers.count) : $($FileInfo.Name)" >> $LogFile
           Write-host("$todaylog Download $filesCount file(s) : $($FileInfo.Name)")
           $filesCount=$filesCount+1
 
           $file = $OutputDir+ "\" + $fileInfo.Name
 
           $separator = "."
           $parts = $fileInfo.Name.Split($separator)
 
           $file_basename = $parts[0]
           $file_extension = "." + $parts[1]
 
           #Destination de l'archive
           $DestinationFile = $ArchiveDir + "\" + $file_basename + "_" + $todayDate + $file_extension
           #Taille du Fichier
           $filesize=[math]::Round($($file.length / 1kb),2)
           #Comptage des lignes du fichier
           $lines = (get-content $file | measure-object -line).lines
           #$session.MoveFile($FilePattern, $DestinationFile)                                                                                        
           foreach ($transfer in $transferResult.Transfers)
           {
               # Success or error?
               if ($transfer.Error -eq $Null)
               {
                   Write-Host "    $InputDir/$fileInfo          " 
                   Write-Host "Upload of $($transfer.FileName) succeeded, moving to backup"
                   # Upload succeeded, move source file to backup
                   $session.MoveFile(("$InputDir/$fileInfo", $ArchiveDir)).Check()
               }
               else
               {
                   Write-Host "Upload of $($transfer.FileName) failed: $($transfer.Error.Message)"
               }
           }